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基于个体样本的群体遗传分析，其本质是利用重测序方式获得某物种各个亚种（或品系）群体中每个个体样本的 SNP 变异信息，通过 SNP 可以分析各个亚种（品系）间的遗传进化关系。个体样本策略能获得更精确的个体遗传信息，因此不但可以通过选择压力分析研究群体的适应性机制，同时，还可以通过深入的群体关系分析，更全面地了解群体的进化历史，丰富群体的适应性研究。

应用领域

（1）物种在不同生存条件下的自然选择机制研究；

（2）野生种、驯化种以及改良种的人工选择机制研究；

（3）种群历史与进化研究。

技术路线

分析内容

样品要求

1. 全基因组重测序：样品浓度≥30ng/μL；总量≥6 μg ；OD260/280 = 1.8~2.0。

2. 简化基因组测序：样品浓度：≥25 ng/μL，总量≥2 μg ；OD260/280 = 1.8~2.0

3. 推荐样本数：建议每个群体大于10个样本，若样本数达到30；对群体多样性的各项指标计算会更加准确

项目周期

一般在55个工作日，具体完成时间视项目具体规模（样本数和表型种类数）而定。

参考文献

[1] Ahrens C W, Byrne M, Rymer P D, et al. Standing genomic variation within coding and regulatory regions contributes to the adaptive capacity to climate in a foundation tree species[J]. Molecular Ecology, 2019, 28(10): 2502-2516.

[2] Fustier M, Martinezainsworth N E, Aguirreliguori J A, et al. Common gardens in teosintes reveal the establishment of a syndrome of adaptation to altitude.[J]. PLOS Genetics, 2019, 15(12).

[3] Wang J, Hu Z, Upadhyaya H D, et al. Genomic signatures of seed mass adaptation to global precipitation gradients in sorghum[J]. Heredity, 2020, 124(1): 108-121.

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