GeoMx DSP空间靶向蛋白组是一种基于抗体的空间蛋白质组学技术，技术关键在于使用光可切割子（PC）将寡核苷酸标签（DSP barcode）与抗体连接，预先将修饰抗体混合物与组织切片孵育，当紫外光投射到组织切片时，释放DSP barcode，通过检测DSP barcode序列读出组织原位表达的蛋白质及其丰度，实现了在组织切片原位检测多达100+种蛋白表达谱。这100多种蛋白靶标被划分为7个不同的功能单元，如免疫细胞marker、免疫标志物、信号通路等，用户可根据实际研究需求选择。

应用领域

1. 空间异质性分析；

2. 肿瘤微环境研究；

3. 免疫系统反应研究；

4. 神经科学研究；

5. 肿瘤免疫治疗。

技术路线

分析内容

标准信息分析：

1. 数据统计与评估：各个样本数据基本质控、背景质控、数据过滤、表达定量；

2. 组织切片全景图：图像结果，包含全切片图及各ROI/AOI精细图；

3. 全局表达图谱：蛋白表达热图、相关性分析；

4. 差异分析：差异蛋白统计、差异比较火山图、箱线图；

样品要求

1. 物种限制：仅限人和小鼠

2. 冷冻包埋（OCT包埋）

样本类型：制备好的冷冻包埋样本；

3. 石蜡包埋（FFPE）

样本类型：制备好的石蜡包埋样本；

样本质量：选择1-2年内的蜡块做蛋白分析。

4. 石蜡切片

样本类型：实验前4周内新制切片做蛋白分析；

样本数量：每个样本提供5~6张切片。